特殊配方奶粉与普通配方奶粉的区别，就是构成的成分。如果您的宝宝对普通奶粉过敏，主要原因是来自对牛奶中的β-乳球蛋白过敏，β-乳球蛋白是一种蛋白质，如果将蛋白分子切的更细更小，就可以减少过敏的产生，称之为“水解蛋白”，市面上所说的特殊配方奶粉，大多是指的就是这种水解蛋白的配方奶粉。而普通奶粉中都是含有完整牛奶蛋白分子，故建议家长还是需遵医嘱选择适合宝宝过敏程度的水解配方奶粉。
另一方面，普通配方奶粉与特殊配方奶粉的主要区别还在于购买方式！普通配方奶粉在超市母婴店都可以买到，妈妈可以根据孩子的年龄自主选择购买。特殊配方奶粉则要在医生指导下在医院购买，不可以在超市销售。