恶性葡萄胎的最主要治疗方法是清宫手术。因为葡萄胎随时都会有大出血的可能，所以一经发现就要及时采用吸宫术清宫。手术过程中，子宫会逐渐缩小、变硬，吸出物含血量比较多，但都是一些淤血，所以不会影响患者的血压、脉搏等。即使是子宫胀大到七、八个月的患者都有可能用吸宫术顺利清理。第一次清宫的时候不一定要完全清理干净，不然会损伤宫壁，可以在一个星期后再做第二次刮宫手术。
如果不采取清宫手术，就要切除子宫。但是采取子宫切除的患者最好是在40岁以上没有生育要求的，年轻的患者还是建议保留卵巢的。子宫大于5个月妊娠者在切除之前，应经阴道清除宫腔内大部分水泡状胎块，以方便手术处理。
另外，贫血患者还可以通过输血改善情况，长期流血、食欲不振的患者则可以纠正电解质紊乱，为了避免感染，患者还要使用一些抗炎药物等。